Með 1960 járnsmiður ekki lengur gert upp meirihluta fullorðinna atkvæðagreiðslu aldri, en hreyfing að skrá járnsmiður fyrir atkvæðagreiðslu hitti samræmdu mótstöðu. Árið 1962 sambandsríki dómstóll fyrirskipaði Háskóla Mississippi til að skrá James Meredith sem fyrsta svarta hennar nemanda. Defiance af stærðargráðunni leiddi seðlabankastjóra Ross Barnett, og alvarleg rioting braust út við skólann. Federal hermenn þurfti að hjálpa Meredith inn í háskóla. Aðrar kynþátta ofbeldi ma morð í 1963 á borgaraleg réttindi leiðtogi Medgar Evers, og árið 1964 á þremur borgaraleg réttindi starfsmanna.
Um miðjan 1960, þátttöku járnsmiður í stjórnmálum aukist. 1969 Charles Evers, bróðir Medgar, var kjörinn borgarstjóri Fayette-fyrsta svarta borgarstjóri í biracial Mississippi bæ síðan uppbyggingu. Einnig í lok 1960, hvít andstöðu við almenna skóla samþættingu leitt til kynþátta truflana. Snemma 1970, dómi pantaði desegregation opinberra skóla á öllum stigum var í gangi.
Árið 1969, opnaði Mississippi Band of Choctaw indíána vinnustaðnum til að byggja heimili fyrir meðlimum ættkvísl. Þetta fjölgað mikið fé samstæðunnar og gerði þetta band eitt af efstu vinnuveitendur í því ríki.
Í lok 1980, var lagabreytingum til umbóta fylki ríkisstjórn og auka fé til menntunar. Kjósendur kjósa fyrsta repúblikana landstjóra síðan uppbyggingu, Kirk Fordice, árið 1991.
Í upphafi 2000s, the hönnun af the ástand fána, samþykkt árið 1894, varð efni af deilum vegna þess að horn birtist á Civil War Merki af Confederate States; African-Bandaríkjamenn og aðrir voru vegna táknmáli sem tengist þrælkun. A landstjóri skipaður framkvæmdastjórnin lagt til nýja hönnun, en árið 2001 kjósendur höfnuðu nýja hönnun í þágu 1894 útgáfu.
Hurricane Katrina skall Gulf Coast 2005 og olli miklum skemmdum. Sérstaklega erfitt högg var svæðið í kringum Biloxi og Gulfport.
