Á 1956-57 árstíð, Baylor meðaltali 29.7 stig og 20,3 fráköst og setja á áður inconsequential Seattle U. program á kortið. Á næsta ári, leiddi hann höfðingjarnir til NCAA Championship leiknum gegn sterkri Kentucky. Þó Seattle tapaði 12 stig, Baylor vann Most Outstanding Player verðlaun mótsins. Hann fór í háskóla á ári snemma og undirrituð með Lakers (enn í Minneapolis) fyrir $ 20.000, lausnargjald a konungs á þeim tíma.
Baylor upplifað marga hár og nokkrar ofan, á ferli sínum. Hann meðaltali 24.9 stig sem nýliði í 1958-59 og í þriðja sæti í deildinni í rebounding bak Bill Russell og Bob Pettit, en Lakers voru hrífast af playoffs eftir Boston, fjóra leiki til enginn. Í preseason það ár, Baylor, ferðast með Lakers fyrir sýningu leiksins, var neitað hótelherbergi og veitingaþjónustu í Charleston, Vestur-Virginía, vegna þess að hann var African-American. Það var eitt af mest overt athafna kynþáttafordóma í sögu NBA. Og í janúar 1960, Baylor var um borð lið flugvél Lakers 'þegar stórhríð neyddist flugmaðurinn að lenda henni í Iowa kornakur. Enginn var meiddur.
Árið 1959, eigandi Bob Short ráðinn John Castellani, Baylor College þjálfari Seattle, þjálfara Lakers. En Elgin var í hernum þegar æfingabúðir hófst, og Castellani var glataður án hans. Hann yrði rekinn eftir 36 leiki. Skömmu eftir að koma aftur til liðsins, Baylor skoraði 64 stig gegn Boston, brjóta Joe Fulks 'NBA met 63. Ári síðar, Baylor sett fleiri met með 71 stig gegn New York.
Einn af merkustu leikjum í sögu NBA kom 8. desember 1961, í Philadelphia. Chamberlain var 78 stig (brot met Baylor er) og 43 fráköst. Baylor var 63 stig og 31 fráköst. Lakers vann í þriggja-yfirvinnu.
Kalsíum innstæður í báðum hnjám át burt á skilvirkni Baylor í byrjun 1960. Á meðan, the Lakers áfram baráttu þeirra í úrslitum, tapaði fyrir Celtics árið 1962, 1963, og 1965. Í apríl 1965, Baylor orðið mölbrotna vinstri kneecap, og það voru hvíslar að ferill hans var á. Hann gerði það aftur fyrir 1965-66 tímabilið en var skuggi af fyrrverandi sjálf hans, að meðaltali feril ofan í stig og fráköst. Þá skyndilega, tók hann eldur síðustu vikur tímabilsins og í úrslitunum meðaltali 29 stig og tók 13 fráköst gegn St. Louis Hawks í Vestur Division úrslitum. Því mið
