Árið 1865, frægasta bók Bernard er, Kynning á fræðslu um tilraunalyf Medicine, var birt. Þar sem hann hélt því fram að lyfið væri aðeins þróast ef miðað tilraunalífeðlisfræði. Hann hrakti einnig hugmynd um "lífsorku" sem fullnægjandi skýringu fyrir lífinu. Hann lagði þá hugmynd af "innra umhverfi" - sem samanstendur af humors (blóð, phlegm, kóleru [gulur galli] og depurð [svart gall]), í blóði og eitlum, sem helst stöðug þrátt fyrir breytingar innan og án lífvera. Þegar þetta stöðugt umhverfi er að trufla, lífveran setur strax um að endurheimta það. Bókin varð til kosningar hans til franska Academy.
Í 1870 er, Bernard hóf rannsóknir á nýju sviði sem leiddi til útgáfu, eftir dauða hans, fyrirbæri lífsins algengt að dýr og plöntur. Bernard dó 10 Feb 1878, í París, nýrnasjúkdóm. Hann var fyrsti franski vísindamaðurinn sem afrek voru haldin með ástand jarðarför.