World War II (1939-1945) rofin fræðileg feril Menzel er. Frá 1942 til 1945, sem flugstjóri, starfaði hann í bandaríska sjóhernum og kenndi cryptology, sem felur í sér að búa til og þýða skilaboð í leyndarmál merkjamál. Hann gerði einnig rannsókn á áhrifum sól starfsemi á útvarp-bylgju samskipti og útvarp fjölgun. Stríðið sýnt fram á gildi þess að útvarp samskipti og áhrif af starfsemi sólar á það. Síðar, Menzel hjálpaði US Air Force koma Observatory á Sacramento Peak nálægt Alamogordo, Nýja Mexíkó.
Menzel áfram að sérstaklega heilluð af sól Myrkvi, og hann leiddi eclipse leiðangur til Síberíu árið 1936. Hann ferðaðist hnötturinn og varð vitni yfir tugi sól Myrkvi í ævi hans.
A hugmyndaríkur höfundur, á meðan að vinna á doktorsnám hans við Princeton hann hjálpaði til að styðja sig með því að skrifa vísindaskáldskapur sögur. Síðar í lífinu, hann var ritstjórn ráðgjafi ýmissa tímarita, þar á meðal Galaxy Magazine, vísindaskáldsögu dagbók. Þrátt fyrir áhuga hans á vísindaskáldsögu, þó skrifaði hann þrjár bækur Debunking UFO og visitatium með geimvera verur. Hann hélt slík fyrirbæri voru afleiðing annaðhvort birtingarmyndum ýmsum náttúrufyrirbærum eða sjón blekking.
Menzel hjálpaði vinsælan á sviði stjörnufræði. Hann skrifaði nokkrar bækur ætlað til almennings, þar á meðal Field Guide til stjarnanna og plánetanna (1964), vinsæll handbók fyrir upphafi stjörnufræðinga og sólin okkar (1949), venjulegu tilvísun því efni.
Auk þess með fræðilegum feril sinn, Menzel starfaði einnig sem ráðgjafi fyrir ýmis stjórnvalda og hernaðarlegra stofnana. Hann var vel kunnugur John F. Kennedy, sem svarar oft með honum á formennsku Kennedy varðandi ýmsum pólitískum og vísindalegum málum.