Árið 1931, Hess varð prófessor í eðlisfræði við Háskólann í Innsbruck. Þar sem hann stofnaði hár-hæð stöð í Ölpunum til rannsóknar á geimgeisla.
Árið 1937 Hess aftur í Háskóla Graz. Árið 1938, nasista ríkisstjórn Þýskalands tók Austurríki. Hess var vísað frá háskóla störfum, bæði vegna þess að hann hafði verið fulltrúi vísindanna í fyrri sjálfstæðu austurríska ríkisstjórnin og vegna þess að hann var Roman Catholic og kona hans var Gyðingur. Nasistar ekki samþykkt annaðhvort trú. Fjórum vikum áður en þeir áttu að vera handtekinn og sendur í fangabúðum, Hess og kona hans slapp til Sviss. Þau fluttu til Bandaríkjanna síðar sama ár.
Frá 1938 til starfsloka hans í 1956, Hess var prófessor í eðlisfræði við Fordham University í New York. Hann varð bandarískur ríkisborgari árið 1944. Árið 1946, Hess fram próf frá Empire State Building fyrir geislavirkni á svæðinu og Cosmic geisli bombardment. Í 1950, þátt hann í öðrum rannsóknum á geislavirkni á svæðinu frá kjarnorkuvopnum prófunum. Hann áherslu á líffræðileg áhrif geislavirkni frá bæði Cosmic geislun og kjarnorku próf.
Marie Hess lést árið 1955. Síðar það ár, Hess giftist Elizabeth M. Hoenke, hjúkrunarfræðingur sem hafði annast fyrir konu sinni. Hess átti engin börn. Hann lést á desember 17, 1964.