Tveimur árum eftir birtingu Uppruna tegundanna, Bates lesa blaðið, "Framlög til skordýr dýralíf Amazon Valley," að Linnean Society (áður sem Darwin hafði fyrst skýrði skoðanir sínar í 1858). Í ritgerðinni sett fram uppgötvun Bates er að nokkrir mismunandi tegundir fiðrildi hafa nánast eins lit mynstur á vængi sína aðeins sum hver hindra fugla rándýr. Bates hélt því fram að náttúrulegt val og lifun fittest olli fiðrildi vængi að líkja eftir mynstrum sem auka lifun líkur. Áður Bates birt grein hans, önnur naturalists hafði tekið líkt í lit mynstrum meðal ákveðinna hópa fiðrildi inhabiting sama landsvæði. Bates var fyrstur til að bjóða upp á fullt vísindalega skýringu á því. Þetta fyrirbæri, sem nú heitir Batesian mimicry, staðfest fullkomlega kenningu Darwins um náttúruval. Nota gögn Bates er, Darwin gat hrekja gagnrýnendum sínum í stuttum, óundirritaður endurskoðun í Natural History Endurskoðun 1863.
Í 1863, Bates birt náttúrufræðingi á River Amazon, þar sem hann lýsti bæði leiðangur sinn og vísindalegar uppgötvanir hans.
Árið 1864, Bates varð aðstoðarutanríkisráðherra Royal Landfræðileg Society of London, staða sem hann hélt í 28 ár. Hann ritstýrði dagbók sína og málsmeðferð og starfaði sem ráðgjafi eða aðstoðarmaður öðrum vísindaritum, þar á meðal The entomologist. Bates lagt meira en 100 vísindalegar ritgerðir um Skordýrafræði til fræðitímaritum, sem unnið honum allan heim frægð sem preeminent vald á Coleoptera, röð samanstendur bjöllur. 
[1] [2]