Non-innfæddur tegundir kynnt til eyjanna -. Hvort í dag þegar flugvél snertir niður eða hundruð árum þegar landkönnuðir lent - keppt við landlæg dýralíf fyrir mat. Taktu geitur, til dæmis. A handfylli af höfrum voru fluttir til Santiago Island í 1800s og eru nú taldar eru hátt í 100.000. The Galapagos geit íbúa lifir á móðurmáli gróður og keppir við risastór tortoises til matar, bókstaflega borða nokkrar tegundir í útrýmingarhættu.
Þar ferðaþjónustu hófst á Galapagos árið 1960, náttúruvernd tilraunir hafa verið staðfest á eyjunum. The Charles Darwin Foundation, rekinn í hagnaðarskyni stofnun lagt áherslu á vísindalegar rannsóknir og varðveislu, er virkur viðveru. Auk, Ekvador ríkisstjórnin stofnaði 90 prósent af eyjaklasi sem dýralíf varðveita, Galapagos-þjóðgarðurinn og Galapagos Marine Reserve.
Undir nýju lögum um sérstakt fyrirkomulag fyrir Galápagos, ríkisstjórnin er að reyna að takmarka flæði , stjórna þróun og vernda innfæddur tegundir og vistkerfi. Þrátt fyrir náttúruvernd viðleitni, World Heritage Committee bætt Galapagos til lista UNESCO yfir World Heritage Sites í hættu árið 2007.