Árið 1989 var Coast Guard leiddi hreinsun næstum 11 milljónir lítra (42 milljónir lítrar) af hráolíu sem hellt Prince William Sound í suðausturhluta Alaska. Þessi olía leki harmleikur er sá stærsti í Norður sögu Bandaríkjanna. Það átti sér stað eftir að US tankskip Exxon Valdez laust á Reef í hljóði. Um 100.000 innflytjendur flýja Kúbu og Haítí var meinað að slá Bandaríkjunum ólöglega af Landhelgisgæslu frá 1992 til 1994. Einnig The Coast Guard veitt þjónustu sína á Persaflóa stríðið 1991 og Íraksstríðsins, sem hófst árið 2003.
Árið 2003, það var annar breyting fram. Á þessu ári Coast Guard var flutt frá Department of Transportation að nýstofnaða Department of Homeland Security. Áherslan Department of Homeland Security var á að vernda landið gegn hryðjuverkum.