Eitt vandamál með eytt kjarnorkueldsneyti er að það er búið að breyta af fission ferli. Þegar stór úran atóm eru skipt, búa þeir aukaafurðir - geislavirkar samsætur nokkurra léttari þætti, svo sem sesíum-137 og strontíum-90, sem kallast fission vörur. Þeir eru heitur og mjög geislavirkt, en á endanum, yfir 30 ára tímabil, rotnun þeir í hættuminni form. Það tímabil er kallað helmingunartími. Auk þess, sumir úran atóm handtaka einnig taugafrumur og mynda þyngri frumefni, svo sem plutonium. Þessir transuranic þættir mynda ekki eins mikill hiti eða nístandi geislun sem fission vörur, en þeir taka mikið lengri tíma að rotna. Plúton-239, til dæmis, hefur helmingunartíma 24.000 ár. [Heimild: Nuclear Regulatory Framkvæmdastjórn]
Þessi hár-geislavirks úrgangs frá reactors er hættulegt mönnum og annað líf því það getur gefið burt a gríðarstór, banvæn skammtur af geislun frá jafnvel í skamman tíma. A áratug eftir eldsneyti samkoma er fjarlægt úr reactor, til dæmis, gefur það burt 200 sinnum eins mikið geislavirkni í klukkutíma sem það tekur að drepa mann. Og ef úrgangurinn kemst í grunnvatn eða ám, gæti það inn í fæðukeðjuna og stefnt fjölda fólks. [Heimild: Nuclear Regulatory Framkvæmdastjórn]
Þar sem úrgangur er svo hættulegt, eru margir órólegur um að hafa 60.000 tonn af því sitja á kjarnorkuverum nálægt helstu borgum. En að finna öruggan stað til að geyma það hefur ekki verið auðvelt. Í áratugi, US Federal ríkisstjórn, til dæmis, hefur verið að rannsaka möguleika á að geyma það inni Yucca Mountain í Nevada, 90 mílur (144.8 km) utan Las Vegas. Þrátt fyrir sterka andmæli, Congress samþykkt verkefnið árið 2004. En árið 2009, Obama Administration Energy framkvæmdastjóra Steven Chu tilkynnt að áætlun var verið afskrifuð og að úrgangur verður geymd á staðnum plöntur fyrr en stjórnvöld finnur aðra lausn [Heimild: Hebert] .