Árið 1964 Temin, þá dósent við Háskólann í Wisconsin í Madison, lagði til að An RNA veira gæti endurtaka sig í DNA hýsilfrumunnar. Vísindamenn gagnrýnt tilgátu Temin vegna þess að það fór gegn hefðbundnum hugsun, sem fram kemur að erfðafræðilegar upplýsingar liðin í eina átt, frá og með DNA, þá fara að RNA, og að lokum að prótíni. Temin og Baltimore rannsakað hvernig RNA veira, sem hefur ekki DNA, tókst að fara erfðaupplýsingar sína inn í hýsilfrumu. Bæði vísindamenn komist ensím sem virkjað einþátta RNA veira að endurtaka sig og því verða í samræmi við tvíþátta DNA hýsilfrumu.
Vegna þess að þetta ensím leyft erfðaupplýsingar að renna úr RNA og DNA, það hét vixlrita. Fyrir þessa uppgötvun, Baltimore og Temin vann 1975 Nóbelsverðlaun í lífeðlisfræði eða læknisfræði, sem þeir deila líka með Dulbecco.
Árið 1972, Baltimore var skipaður prófessor í líffræði við MIT. Í tengslum við rannsóknir hans á MIT, Baltimore og samstarfsmenn hans samþætt hluta gen spendýra, þar með efla sviði erfðatækni. Ári síðar, Baltimore hét American Cancer Society prófessor örverufræði, stefnumót sem inniheldur fjárhagslegan stuðning við rannsóknir um líf hans. Frá 1982 til 1990 starfaði hann sem forstöðumaður Whitehead Institute for Biomedical Research við MIT. Árið 1990 tók hann við stöðu sem forseti Rockefeller University, en ári síðar, var hann neyddist til að stíga niður úr stöðu vegna deilum tengslum við rannsókn vísindamaður Thereza Imanishi-Kára.
Í 1986, en Baltimore var enn við MIT, Imanishi-Kari birt rannsóknarritgerð sem gerð er grein kenningu um ónæmiskerfið kerfi sem byggist á tilraunum hún hafði gerðar á músum. Auk þess að Imanishi-Kára, pappír skráð fimm Coauthors, þar á meðal David Baltimore. Þótt skýrslan lagði Nontraditional mynd af því hversu ónæmiskerfið virkar, var það gögn skýrslunnar og ekki kenning, sem vakið deilur. Næstu 10 árum, heiðarleiki vinnu Imanishi-Kára var yfirheyrður. Baltimore var aldrei sakaður um hvaða ranglæti, en þó svo, að nafn hans myndi verða órjúfanlega tengd lengsta-hlaupandi bandaríska rannsókn vísinda svik.
Þegar postdoctoral nemandi, Margot O'Toole, var ekki að endurtaka Imanishi Niðurstöður -Kari er, O'Toole fór að gruna að Imanishi
