Eins og forstöðumaður NHGRI, Collins umsjón Bandaríkin hlutverk í genamengi mannsins Project, alþjóðlega viðleitni til að kortleggja genamengi mannsins ( heill setja af genum í klefa). The Human Genome Project hófst árið 1990 sem forrit til að ákvarða allt sett af leiðbeiningum efna sem stjórna erfðir í mönnum og tilteknum öðrum lífverum. Vísindamenn telja að með því að skilja genamengi mannsins, þeir vilja vera betur í stakk búnir til að finna og skilja tengsl milli gena og sjúkdóma. Þessi þekking mun ráðast í byltingu á sviði læknisfræði. Það mun leiða til einstaklingsbundinnar fyrirbyggjandi lyf, þar sem einstaklingar taka erfðafræðilega próf og þá fá lyf eða fyrirbyggjandi meðferð sem byggist á persónulegum gena sinna. Það mun einnig leiða til þróunar á skilvirkari lyf og meðferðir byggjast á dýpri skilning á vélfræði sjúkdómsins.
Auk þess að kortleggja genamengi mannsins, verkefnið er einnig ætlað að þróa tækni sem mun aðstoða vísindamenn og læknar í greina upplýsingar fékk frá erfðafræðilegum prófum. Verkefnið stuðlar einnig að þjálfa Corps vísindamanna til að nýta tækni og fjármagn þróað í gegnum verkefnið á þann hátt að bæta heilsu manna.
Annar mikilvægur þáttur í genamengi mannsins Project er skoðun sem hægt siðferðileg, félagsleg, og lagaleg atriði sem kann að hljótast af genamengi mannsins rannsóknum. Collins hefur verið í fremstu röð slíkra mála, sem fela spurningar um hvernig fólk mun nota eigin erfðaupplýsingar þeirra og erfðafræðilegar upplýsingar annarra.
Collins hefur einnig reynt að tryggja almenningi aðgang að niðurstöðum verkefnisins, svo að vísindamenn um allan heim geta notað það til að fara þekkingu um erfðafræðilega? og hagnýt forrit hennar. 
[1] [2]