Sanger sneri þá athygli sinni að greiningu á kjamsýrusameinda, einkum ribósakjarnsýru (RNA) og DNA . Þessar sameindir innihalda nokkur hundruð eða þúsundir smærri efna einingum sem kallast kirni. Sanger þróað nýja tækni til raðgreiningar kirni. By 1977, hafði hann og rannsóknir hans lið komið röð meira en 5.000 kirni meðfram strandar á DNA frá bakteríum veira. Þetta raðgreiningu vinna var viðurkennd með Sanger er annað Nóbelsverðlaunin árið 1980. Sanger og hópur hans síðar raðgreint um 16.000 kimi í DNA manna hvatbera, hlutar frumu sem breyta efnaorku úr fæðu í orku formi klefi getur notað. Þau fluttu þá á að Sequence á 172.000-plús kimi af Epstein-Barr veira.
Hann fékk Royal Society Royal Medal árið 1969, og Copley Medal þess árið 1977. Hann hét yfirmaður stærðargráðunni breska heimsveldið árið 1963. Sanger fékk William Bate Hardy verðlaun Cambridge heimspeki árið 1976. Árið 1979 vann hann Albert Lasker Basic Medical Research Award.
Hann hefur skrifað margar greinar um vísindatímaritum. Sumir af skrifum hans var safnað í Selected Papers Frederick Sanger, með skýring, sem birt var í 1996.