tilbúið ammoníak gæti einnig hæglega breytt í sprengiefni, og eins og World War I (1914-1918) byrjaði, Haber boðið þekkingu sína til þýska ríkisins. Undir hans, Institute framleitt svo mikið sprengiefni skotfæri sem það vistað þýska heri frá afhendingu á þeim tíma þegar skotfæri þeirra hafði nærri keyrt út. Haber umsjón einnig tilraunir í Efnavopn, og velgengni hans í að þróa klórgas fært um það bil 15.000 bandamanna herlið mannfall, sem 5000 voru dauðsföll, þegar hún kom út með tilraunum á vígvellinum apríl, 22, 1915.
Þó Haber var 1918 nóbelsverðlaunahafi í efnafræði, það var ekki fyrr en 1919, eftir stríðið, sem hann fékk verðlaun hans. Hann hafði verið sérstaklega vitnað til góða uppgötvun hans hafði fært heiminum, og hann var mjög skelkaður þegar það var samt sem áður upp alþjóðleg mótmæli gegn sigra hans, vegna aðgerða hans í stríðinu.
Milli stríð Haber unnið að þróun ferli til að draga gull úr sjó, sem hann vonast myndi hjálpa að greiða hinum gríðarmiklu eftirstríðsárunum skaðabætur bandamenn höfðu krafist Þýskalands. Þótt leitast mistókst, undir stjórn Haber er, Kaiser Wilhelm Institute varð einn af stærstu vísinda heims rannsóknaraðstöðu, teikna alþjóðlegur hópur ljómandi hugum alls aga.
Með hækkun á nasista krafti, allt Haber er Jewish starfsmenn voru neydd til að segja, og sem ert Gyðingur sjálfur, sagði hann eins og heilbrigður. Hann var boðið hæli í Cambridge-háskóla, en var aðeins fjórum mánuðum. Framlög Haber er til framförum á sviði vísinda, þrátt fyrir deilur í kringum stríð starfsemi sína, voru víða getið og virt á ævi hans.
Eftir dauða Haber er, þýska eðlisfræðingur Max Theodor Felix von Laue leiddi frumkvæði að endurnefna Kaiser Wilhelm Institute í minni Haber er. Það er nú þekkt sem Fritz Haber Institute.