Eigen var meðhöfundur í bók, lögum leiksins (1981), sem lagt nokkrar kenningar. Í bókinni, sem hann og meðhöfundur Ruthild Winkler kanna hvernig þættir tækifæri stjórna náttúrunni. The tveir talið að tækifæri og nauðsyn liggja alla atburði. Til að útskýra kenningar sínar, þeir nota hugmyndir úr mörgum fræðasviðum, þar á meðal almenna vísindi, heimspeki, félagsfræði, líffræði og fagurfræði. Eigen og Winkler sett fram nokkra leiki sem dæmi til að sýna hugmyndir sínar. Vísindamenn hafa notað Eigen er slökunartækni að rannsaka ensím-hvarfa og kóðun líffræðilegum upplýsingum.
Eigen hefur hlotið fjölda viðurkenninga fyrir verk sín. Hann vann Otto Hahn verðlaunin fyrir efnafræði og eðlisfræði árið 1962. Árið 1967 var hann móttakandi Linus Pauling Medal of the American Chemical Society. Og árið 1977, vann hann Faraday Medal of Royal Society. Hann hefur fengið heiðursdoktorsgráður frá háskóla í Evrópu og Bandaríkjunum. Hann hefur einnig skrifað meira en 100 greinar og margar bækur.