Berthollet einnig þátt í a langur-hlaupandi deilu við efnafræðingur Joseph Louis Proust, sem hafði lagt til að þættir gera upp hvaða sýnishorn af hreinu efnasambandi voru alltaf í ákveðin, eða föstu, hlutföllum. Tilraunir Berthollet leiddi hann til að trúa annars og hann hélt því fram vociferously gegn Proust í mörg ár. Hann var að lokum reyndist rangt og lögmál ákveðin hlutföllum var stofnað, en þessar umræður með bæði Lavoisier og Proust beðið frekari mikilvægar uppgötvanir í efnafræði.
Berthollet tók þátt í sínum mikilvægu störfum undir fjórum mismunandi fyrirkomulagi. Napoleon nefndi hann forstöðumaður myntu. Hann varð þingmaður, Grand yfirmann Legion Heiður og telja í 1804, og starfaði á nokkrum umboð, allt frá peningamálum umbætur í listaskóla endurreisn.
Berthollet uppgötvaði samsetningu blásýru (hydrocyanic) sýru , sulfurated vetni (vetnissúlfíð), og ammoníak; að þróa aðferð til að draga út járn til framleiðslu á stáli; og skapað undirbúning kalíum chlorate sem leiddi fyrstu flugelda lit. Hann stofnaði einnig Ecole Polytechnique með samstarfsfólki Gaspard Monge og Louis B. Guyton de Morveau. Með Marquis de Laplace, stofnað hann Société d'Arcueil, umræðu hópur sem fylgir sumir af the framúrskarandi vísindamanna í dag.