Með 1971, Boyer hafði náð umtalsverðum árangri í að skilja ATP myndun. Í eftirfarandi áratug, gerði hann fleiri uppgötvanir varðandi þremur postulates fyrir bindandi kerfi ATP myndun. Frekari prófanir Boyer og rannsóknir hans lið staðfesti niðurstöður. Boyer sýndi að ensímið ATP synthase hjálpartæki framleiðslu á ATP, og John Ernest Walker Bretlands uppgötvaði uppbyggingu ATP synthase. Fyrir vinnu sína, en tveir vísindamenn deilt helmingur 1997 Nóbelsverðlaun í efnafræði. Hinn helmingurinn verðlaunanna hlaut Jens Skou Danmerkur.
Árið 1955, Boyer hlaut verðlaunin í ensím efnafræði American Chemical Society. Hann fékk einnig Guggenheim Fellowship sem leyfa honum að taka orlof og stunda rannsóknir í Svíþjóð í Wenner-Gren Institute við Háskólann í Stokkhólmi og Nobel Medical Institute. Hann starfaði sem formaður lífefnafræði hluta American Chemical Society frá 1959 til 1960. Frá 1969 til 1970 var hann forseti American Society of Biological Efnafræðingar. Árið 1970 var hann útnefndur prófessor emeritus við Department of efnafræði og lífefnafræði í UCLA. Árið 1989 fékk hann Rose Award American Society fyrir lífefnafræði og sameindalíffræði.