retróveirum treysta á prótein hvati heitir próteasa ensím sem hluti af æxlun þeirra. Hindra að prótein kastar api skiptilykill í retróvirus 'vélar eyðileggingu. Reyndar eru slík próteasahemlar þegar notað við HIV sýkingu hjá alnæmissjúklingum [Heimild: Britannica].
Því miður, vondir út uppbyggingu slíkra prótína er einn af erfiðustu þrautir við vitum af. Ímyndaðu þér að fylla risastór kassi með flækja jólatré ljós disused Slinky leikföng, gaddavír, vegur borði og electromagnets, þá hrista það og snúa það í kring, og að lokum að reyna að giska á hvaða form þú vilt gera. Þú hefur aðeins byrjað að klóra yfirborðið á margbreytileika þetta verkefni. Prótein geta samanstanda af fleiri en 10.000 atómum hvor, mynda keðjur, undir-keðjur og skuldabréf óteljandi samsetningar; í raun, það eru fleiri leiðir til að brjóta prótein en það eru atóm í alheiminum [Heimild: BOHANNON].
Svo flókið er meira en jafnvel supercomputer getur stundum séð, sérstaklega vegna þess að tölvurnar eru ekki sérstaklega góður í vinna með þrívíðu form. Svo, vísindamenn byrjaði að leita að hraðari og árangursrík leið til að sprunga mannvirki prótein. Lausn þeirra? Notaðu meðfædda staðbundna greiningu getu heilann. Foldit fæddist. Næstum strax, fór það að borga arð.
Í þessum næsta hluta, munum við taka a loka líta á hvernig Foldit virkar, hvað leikur hafa komið með það og hvort þeir lækna HIV.
Molecular Clockwork
Ómissandi hluti af iðn Úrsmiður samanstendur af samsetningu safn viðkvæma hluta innan sem samningur rúm og mögulegt er, en tryggja að fastur misserum ekki trufla ekki með það hlutverk timepiece er.
Í Foldit leikmenn nota einföld kassa af verkfærum til að vinna lögun prótína. Hugmyndin er að beygja, snúa, færa og hrista hliðarkeðjum prótínsins og amínó sýru backbones svo að öll uppbygging er pakkað í bestu lögun sinni. Leikmennirnir vita lausn þeirra virkar þegar þeir losna við árekstra milli hliðarkeðjumar atóma, fela vatnsfælin keðjur inni í prótein, takast á við vatnssækna keðjur út og fjarlægja stór tómt rými sem ógna stöðugleika próteinsins - allt sem endurspeglast í skora þeirra.
Staðan ásamt reglum um leyfileg færist dregið af lögum eðlisfræðinnar gilda prótein sofa. Varmafræði segir okkur að náttúruleg kerfi hafa tilhneigingu til ríkja
