Auk þess stór alþjóðleg skip verksmiðju sigla til Galapagos svæði, þar þeir kaupa afla af fiskimönnum. Þessi uppspretta af peningum hvetur Islanders að veiða ólöglega á strandsvæðum sem voru sett til hliðar sem Marine Reserve, og sem eru nú hluti af þjóðgarðinum, og til að fara yfir kvóta af fiski sem þær eru látnar ná. Sharks, einkum eru í hættu á að vera uppurinn. Hátt verð fyrir hákarl fins, sem eru notuð við gerð sumra Oriental súpur, tælt fiskimenn að veiða tugþúsundir hákörlum ár hvert og skera burt fins þeirra.
humar, krabbar, rækjur og önnur krabbadýr eru einnig í hættu, eins og eru skepnur sem kallast sjór agúrkur. Sjór agúrkur, sem tilheyra hópi spiny-skinned sjó skepnur sem kallast skrápdýr, eru verðlaun í Asíu sem er ástardrykkur og þykknun og bragðefni fyrir súpur. Þó að ríkisstjórn Ekvador hefur bannað hugsanlegar fleiri sjó gúrkur, hafa Galapagos kafara haldið áfram að safna þeim, og á mörgum sviðum í eyjum dýrið hefur nánast horfinn.
Í dag er stærsta tekjulind á eyjunum er ferðaþjónustu. Veita þjónustu fyrir ferðamenn og skipum ferðamanna reikninga fyrir meira en helmingur af tekjum vistmannaráð. Fyrir Ecuadoreans í erfiðleikum með að afla sér viðurværis á meginlandinu, til kynna að mikill magn af erlendum gjaldeyri geta hæglega gert í eyjum lokkar fleiri fólk til Galapagos en hagkerfið og landið þolir.
Taka ráðstafanir til að vernda Islands
Það eru reglur sem allir gestir til Galapagos verða að fylgja: Engan trufla eða fjarlægja neitt úr eyjum, jafnvel rokk eða sjó skel; enginn má snerta eða fæða dýrin; allir gestir verða að vera á merktum gönguleiðum og fylgja þjálfun leiðsögumenn; og ferðamenn mega heimsækja aðeins 45 samþykkt gestur vefsvæði. Engu að síður, um 60.000 manns heimsótt Galapagos árlega í 1990, og sameiginlega tilvist þeirra bætir við álag á auðlindir eyjanna.
Handan við reglugerð um ferðaþjónustu, mörg samtök, bæði innlendum og alþjóðlegum, eru að vinna saman til að reyna að leysa vandamál í Galápagos. Á Charles Darwin Research Station (CDR) á Santa Cruz Island, eru vísindamenn ná nokkrum árangri með Hatchling-raise áætlun fyrir risastór tortoises í
