Ýmsar varnarefni eru notuð til að stjórna uppskera skaða. Sjúkdóma sem þola afbrigði af trjám hefur verið þróuð.
The Asian epli sem allar algengar tegundir epli eru fengnar er Malus pumila af rósaætt, Rosaceae.
auða-banded blaða Roller, og mælikvarði skordýr. Hagamýs, sem narta á berki trésins, eru einnig eyðileggjandi. Bakteríur valda sjúkdómum, svo sem fireblight. The sveppur vöxtur sem valda epli ryð, epli hrúður, og mildew eru einnig mjög skaðleg.
